全基因组寡核苷酸表达谱筛选哈萨克族食管癌相关靶基因

Screening of target genes in esophageal squamous cell cancer in Kazakh by oligonucleotide microarray

摘要: 目的　筛选哈萨克族食管癌与正常食管黏膜的差异表达基因。方法　新鲜标本取自哈萨克族食管鳞癌患者。采用ＲＮＡ保护技术保护组织标本，分离癌组织、正常食管黏膜组织标本，提取ＲＮＡ，线性扩增获得足量ｃＲＮＡ，利用基因芯片分别检测癌组织和正常食管黏膜组织基因表达谱，并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果　癌组织和正常食管黏膜组织比较差异１０倍以上共有１７０个基因，其中表达上调（信号比的对数值＞３）有３９个，表达下调（信号比的对数值＜－３）有１３１个。表达异常的基因与细胞周期调节、细胞凋亡、细胞骨架、细胞外基质、细胞内信号传递、蛋白质的翻译合成及免疫功能等相关。结论　利用全基因组寡核苷酸芯片可准确、高效地筛选出哈萨克族食管癌相关的候选靶基因１７０个，这些基因与哈萨克族食管癌的发生、发展有关。